Научные институты с их лабораториями, в которых развиваются конкретные направления и отрасли науки, являются научными подразделениями АГПУ им. Хачатура Абовяна. Руководят институтами ведущие и признанные в данной области науки специалисты.
Каждое научное подразделение имеет свой устав, действует в соответствии с его положениями.
В университете действуют 3 базовых научно-исследовательских института, финансируемых Комитетом по науке МОНКС РА, которые находятся в составе Научно-исследовательского центра университета.
На итоговом заседании Ученого совета директор Научно-исследовательского центра представляет отчет о научных результатах, полученных в лабораториях институтов.
Миссия университета связана с преобладанием педагогических, психологических, методических и арменоведческих тем, при этом большие успехи отмечаются и в других областях науки.
Самым большим достижением университета можно считать НИИ «Шахматы», где с помощью современных приборов исследуется влияние шахмат на психику ребенка.
АГПУ стремится также к получению статуса исследовательского университета, поэтому продолжает повышать эффективность научных исследований за счет создания новых научных институтов, центров и лабораторий, а также включения научных результатов в оборот.
Действующие в составе АГПУ им. Х. Абовяна и финансируемые Комитетом по науке МОНКС РА институты:
1. НИИ «Шахматы», деятельность которого направлена на поддержание и развитие инфраструктуры. Директор: С. Лпутян, научный руководитель программы Ваан Саргсян.
2. НИИ «Сохранение и развитие института естественнонаучных исследований». Руководитель: Э. Коканян:
• «Лаборатория новых материалов квантовой электроники и интегральной оптики»,
• Научная лаборатория «Исследование биологически активных соединений и биобезопасности»,
• Научная лаборатория «Экологический мониторинг и оценка».
3. НИИ «Проблемы трансформационного общества: методологические, историографические и лингвистические аспекты». Руководитель: Асмик Ованнисян:
• Лаборатория «Проблемы трансформационного общества»,
• «Научная лаборатория лингвистических исследований».
